La construcción de la iglesia de los jesuitas se inició en 1628 en un terreno que anteriormente había sido ocupado por el palacio del sexto conde de Orgaz, Don Juan Hurtado de Mendoza. Sus obras fueron dirigidas por diferentes arquitectos, destacando los jesuitas Pedro Sánchez y Francisco Bautista, quienes siguieron fielmente el modelo arquitectónico típico de la Compañía. Las obras finalizaron en 1576 tras la colocación del retablo mayor.
Cuando Carlos III expulsó a los jesuitas de España en 1767, la iglesia estaba destinada a ser parroquia con el título de San Juan Bautista, hasta que fue devuelta a la Compañía en 1937. La Casa Profesa, en cambio, se ha utilizado como sede de diferentes organismos oficiales.
Desde sus torres se puede contemplar una de las vistas más bonitas de la ciudad de Toledo sobre sus tejados.
Se puede visitar todos los días de la semana. Del 1 de abril al 30 de septiembre: de 10:00 a 18:45 horas y del 1 de octubre al 31 de marzo de 10:10 a 17:45 horas. El 1 de enero y el 25 de diciembre está cerrado al público.
